Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms