Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bco2Q99NF1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bco2Q99NF1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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