Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx4Q99NE9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx4Q99NE9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms