Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atoh8Q99NA2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms