Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cadm3Q99N28 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cadm3Q99N28 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cadm3Q99N28 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cadm3Q99N28 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cadm3Q99N28 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms