Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms