Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms