Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nus1Q99LJ8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nus1Q99LJ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nus1Q99LJ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nus1Q99LJ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nus1Q99LJ8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms