Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clcc1Q99LI2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clcc1Q99LI2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcc1Q99LI2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.1 ms