Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nmd3Q99L48 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nmd3Q99L48 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms