Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Q99KU6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q99KU6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q99KU6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q99KU6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q99KU6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q99KU6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q99KU6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q99KU6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q99KU6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q99KU6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q99KU6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q99KU6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q99KU6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q99KU6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q99KU6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q99KU6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q99KU6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q99KU6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q99KU6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q99KU6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q99KU6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q99KU6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q99KU6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q99KU6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q99KU6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q99KU6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q99KU6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q99KU6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q99KU6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q99KU6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q99KU6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q99KU6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q99KU6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q99KU6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q99KU6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q99KU6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q99KU6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q99KU6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q99KU6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q99KU6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q99KU6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q99KU6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q99KU6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q99KU6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q99KU6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q99KU6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q99KU6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q99KU6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q99KU6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q99KU6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q99KU6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q99KU6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q99KU6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q99KU6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q99KU6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q99KU6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q99KU6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q99KU6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q99KU6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q99KU6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q99KU6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q99KU6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q99KU6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q99KU6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q99KU6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q99KU6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q99KU6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q99KU6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q99KU6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q99KU6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q99KU6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q99KU6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q99KU6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q99KU6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q99KU6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q99KU6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q99KU6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q99KU6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q99KU6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q99KU6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q99KU6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q99KU6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q99KU6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q99KU6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms