Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prpf19Q99KP6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf19Q99KP6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms