Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clint1Q99KN9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clint1Q99KN9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clint1Q99KN9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms