Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps4Q99KG7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms