Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pls3Q99K51 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pls3Q99K51 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms