Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp11Q99K46 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp11Q99K46 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp11Q99K46 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms