Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms