Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lims1Q99JW4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lims1Q99JW4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms