Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms