Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Derl1Q99J56 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms