Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ9

Prdm9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm9Q96EQ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm9Q96EQ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm9Q96EQ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prdm9Q96EQ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm9Q96EQ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm9Q96EQ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm9Q96EQ9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm9Q96EQ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm9Q96EQ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm9Q96EQ9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm9Q96EQ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm9Q96EQ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm9Q96EQ9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm9Q96EQ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm9Q96EQ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms