Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1l1Q923U0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1l1Q923U0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1l1Q923U0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1l1Q923U0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tom1l1Q923U0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1l1Q923U0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms