Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim59Q922Y2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms