Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Clip1Q922J3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Clip1Q922J3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Clip1Q922J3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms