Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HlcsQ920N2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HlcsQ920N2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HlcsQ920N2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms