Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b1Q91ZM2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2b1Q91ZM2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2b1Q91ZM2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms