Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms