Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vps36Q91XD6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps36Q91XD6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms