Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE4

UPF0729 protein C18orf32 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WE4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q91WE4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q91WE4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q91WE4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q91WE4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q91WE4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q91WE4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q91WE4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q91WE4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q91WE4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q91WE4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q91WE4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q91WE4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q91WE4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q91WE4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q91WE4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q91WE4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q91WE4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q91WE4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q91WE4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q91WE4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q91WE4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q91WE4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q91WE4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q91WE4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q91WE4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q91WE4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q91WE4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q91WE4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q91WE4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q91WE4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q91WE4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q91WE4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q91WE4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q91WE4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q91WE4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q91WE4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q91WE4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q91WE4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q91WE4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q91WE4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q91WE4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q91WE4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q91WE4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q91WE4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q91WE4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q91WE4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q91WE4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q91WE4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q91WE4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q91WE4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q91WE4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q91WE4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q91WE4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q91WE4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q91WE4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q91WE4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q91WE4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q91WE4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q91WE4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q91WE4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q91WE4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q91WE4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q91WE4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q91WE4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q91WE4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q91WE4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q91WE4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q91WE4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q91WE4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q91WE4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q91WE4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q91WE4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q91WE4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q91WE4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q91WE4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q91WE4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q91WE4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q91WE4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q91WE4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q91WE4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q91WE4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q91WE4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q91WE4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q91WE4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q91WE4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q91WE4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q91WE4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms