Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd3Q91W18 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd3Q91W18 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms