Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms