Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Farp2Q91VS8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Farp2Q91VS8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Farp2Q91VS8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms