Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM4

Psmd2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd2Q8VDM4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd2Q8VDM4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd2Q8VDM4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd2Q8VDM4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd2Q8VDM4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms