Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alg12Q8VDB2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms