Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sft2d2Q8VD57 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms