Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med17Q8VCD5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med17Q8VCD5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms