Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBY2

Camkk1, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camkk1Q8VBY2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camkk1Q8VBY2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camkk1Q8VBY2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms