Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BbxQ8VBW5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms