Protein–RNA interactions for Protein: Q8R570

Snap47, Synaptosomal-associated protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap47Q8R570 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snap47Q8R570 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snap47Q8R570 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snap47Q8R570 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snap47Q8R570 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap47Q8R570 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap47Q8R570 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap47Q8R570 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap47Q8R570 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap47Q8R570 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap47Q8R570 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap47Q8R570 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snap47Q8R570 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snap47Q8R570 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap47Q8R570 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap47Q8R570 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap47Q8R570 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap47Q8R570 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap47Q8R570 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap47Q8R570 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap47Q8R570 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap47Q8R570 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap47Q8R570 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap47Q8R570 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap47Q8R570 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms