Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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Top1mtQ8R4U6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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Top1mtQ8R4U6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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Top1mtQ8R4U6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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Top1mtQ8R4U6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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Top1mtQ8R4U6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top1mtQ8R4U6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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