Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gle1Q8R322 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gle1Q8R322 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gle1Q8R322 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms