Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms