Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Hecw1Q8K4P8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Hecw1Q8K4P8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms