Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk5rap2Q8K389 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk5rap2Q8K389 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms