Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncapd2Q8K2Z4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms