Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stn1Q8K2X3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stn1Q8K2X3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stn1Q8K2X3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms