Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Otud6bQ8K2H2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms