Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colgalt1Q8K297 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms