Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arfip2Q8K221 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms