Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nek9Q8K1R7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms